Kunstmatige Intelligentie in Oncologie - Ondersteuning van wetenschappelijk onderzoek
(Projectleider dr. N. van Trommel, CGOA/VUMC/AVL, gestart 3e kwartaal 2017)
Project 1. Ontwikkelen nieuwe screenings test voor baarmoederhalskanker
Project 2. Ontwikkelen screenings test voor ovariumcarcinoom
Project 1. Ontwikkelen nieuwe screenings test voor baarmoederhalskanker
Baarmoederhalskanker, een zeldzame en behandelbare ziekte, kan evenals de voorloperstadia ervan via een uitstrijkje bij de huisarts worden opgespoord. Bijna de helft van de vrouwen tussen de dertig en zestig jaar die worden opgeroepen voor het bevolkingsonderzoek naar baarmoederhalskanker laat zich niet onderzoeken. De meeste gevallen van baarmoederhalskanker worden bij deze groep vrouwen gesignaleerd. Daarom wordt onderzocht of baarmoederhalskanker en de voorloperstadia ervan met verschillende ziektemerkers (Humaan Papillomavirus, DNA methylering) kunnen worden opgespoord in urine. In samenwerking met TU Twente wordt gewerkt aan de ontwikkeling van een urine-chip ‘lab-on-a-chip’: een mogelijke oplossing om deelname aan het bevolkingsonderzoek te vergroten. De urine-chip zou in de toekomst gebruikt kunnen worden voor bevolkingsonderzoek in ontwikkelingslanden waar minder goede toegang is tot zorg.
Hiervoor worden nu urine, zelf-afgenomen uitstrijkjes uit de vagina en uitstrijkjes van de baarmoederhals verzameld van vrouwen met voorloperstadia en baarmoederhalskanker. Tevens wordt onderzocht of urine kan bijdragen aan het opsporen van andere gynaecologische kankers, zoals baarmoeder- en eierstokkanker.
Project 2. Ontwikkelen screenings test voor ovariumcarcinoom
Eierstokkanker is een zeldzame ziekte die vaak laat wordt ontdekt. Late diagnose is ongunstig.
Door de huidige diagnostiek, waarbij o.a. biomarkers in het bloed gebruikt worden, leiden fout-positieve resultaten tot een verwijzing naar een gespecialiseerd centrum waar een gynaecoloog-oncoloog via een stageringsoperatie vaststelt in welk stadium de ziekte is en welke behandeling nodig is. Deze verwijzing kan o.a. leiden tot:
Daarom bestuderen we de diagnostische waarde van andere biomarkers in de differentiatie tussen goed- van kwaadaardige eierstoktumoren. Gekeken wordt bijvoorbeeld naar human epididymis protein 4 (HE4). Uit de literatuur blijkt dat HE4 specifieker is dan de meest gebruikte biomarker Cancer-Antigen 125 (CA125) en minder fout-positieve resultaten geeft. Recent is aangetoond dat kanker vrije DNA- en RNA-fragmenten (liquid biopsies) in het bloed kan achterlaten. Door middel van analyses wordt gekeken of deze fragmenten van waarde zijn in de diagnostiek van eierstoktumoren. Naast biomarkers in het bloed, wordt ook onderzoek verricht naar de waarde van structuurverandering van DNA, zogenaamde ‘DNA methylering’, in urine en uitstrijkjes van eierstokkankerpatiënten.
Project 1. Ontwikkelen nieuwe screenings test voor baarmoederhalskanker
Baarmoederhalskanker is een zeldzame ziekte, waarvan het mogelijk is voorloperstadia op te sporen en te behandelen. Vrouwen tussen de dertig en de zestig jaar worden opgeroepen deel te nemen aan het bevolkingsonderzoek. Hiervoor wordt er door de huisarts een uitstrijkje afgenomen van de baarmoederhals. Helaas reageren vier van de tien vrouwen niet op de oproep deel te nemen aan het bevolkingsonderzoek. Uit eerder onderzoek is gebleken dat de meeste gevallen van baarmoederhalskanker voorkomen bij vrouwen die niet hebben deelgenomen aan het bevolkingsonderzoek. Om deze reden wordt binnen dit project onderzocht of baarmoederhalskanker en de voorloperstadia daarvan kunnen worden opgespoord in urine aan de hand van verschillende ziektemerkers (Humaan Papillomavirus, DNA methylering). In samenwerking met de Technische Universiteit Twente wordt er gewerkt aan de ontwikkeling van een urine-chip ‘lab-on-a-chip’. Dit zou een oplossing kunnen zijn voor vrouwen die anders niet zouden deelnemen aan het bevolkingsonderzoek. Ook zou deze urine-chip in de toekomst gebruikt kunnen worden voor bevolkingsonderzoek in ontwikkelingslanden waar er minder goede toegang is tot zorg.
Om dit te kunnen onderzoeken en te ontwikkelen wordt er op dit moment urine, zelf-afgenomen uitstrijkjes uit de vagina en uitstrijkjes van de baarmoederhals verzamelt van vrouwen met baarmoederhalskanker en voorloperstadia van baarmoederhalskanker. Daarnaast wordt er onderzocht of urine ook bij kan dragen aan het opsporen van andere gynaecologische kankers, zoals baarmoederkanker en eierstokkanker.
Project 2. Ontwikkelen screenings test voor ovariumcarcinoom
Eierstokkanker is een zeldzame ziekte en in de meeste gevallen wordt de ziekte in een laat stadium ontdekt. In dat geval heeft de ziekte een slechte prognose. Patiënten met een vroeg stadium hebben een goede prognose. Patiënten met verdenking eierstokkanker ondergaan een stageringsoperatie door een gynaecoloog-oncoloog om het stadium en daarmee de noodzaak tot aanvullende therapie te bepalen. De huidige diagnostiek, bestaande uit onder andere biomarkers, is echter niet optimaal waardoor het regelmatig voorkomt dat patiënten met een goedaardige eierstoktumor worden geopereerd door een gynaecoloog-oncoloog. Dit kan leiden tot angst bij patiënten omdat ze verwezen worden naar een gespecialiseerd centrum vanwege een verhoogd risico op kanker en het leidt tot meer kosten omdat de patiënten opnieuw verschillende onderzoeken moeten ondergaan in het gespecialiseerde centrum. Het kan ook voorkomen dat patiënten met eierstokkanker een tweede (stagerings)operatie moeten ondergaan, omdat ze eerst zijn geopereerd in een perifeer ziekenhuis door een algemeen gynaecoloog. Dit leidt tot ongemak bij patiënten omdat zij twee operaties moeten ondergaan. Daarnaast leidt het ook tot meer kosten en leidt het mogelijk tot vertraging in het starten van aanvullende therapie, zoals chemotherapie. Daarom zijn we momenteel bezig met een studie waarin we de diagnostische waarde van andere biomarkers in het bloed onderzoeken in de differentiatie tussen goed- van kwaadaardige eierstoktumoren. We kijken onder andere naar human epididymis protein 4 (HE4). Uit de literatuur blijkt dat HE4 specifieker is dan de meest gebruikte biomarker Cancer-Antigen 125 (CA125) wat leidt tot minder fout-positieve resultaten. Daarnaast is recent aangetoond dat kanker vrije DNA en RNA fragmenten in het bloed kan achterlaten. Door middel van verschillende analyses wordt gekeken of deze ‘liquid biopsies’ van waarde kunnen zijn in de diagnostiek van eierstoktumoren. Naast biomarkers in het bloed, wordt er ook onderzoek verricht naar de waarde van structuurverandering van DNA, zogenaamde ‘DNA methylering’, in urine en uitstrijkjes van patiënten met een eierstoktumor.
(Project manager Doctor N. van Trommel, CGOA/VUMC, initiated 3rd quarter 2017)
Project 1. Developing a new screening test for cervical cancer
Project 2. Developing screening test for ovarium carcinoma
Project 1. Developing a new screening test for cervical cancer
Half of Dutch women eligible for cervical cancer screening, do not attend the screening program. There are many reasons to not participate, varying from lack of time, and fear for the examination, psychological barriers or not seeing the importance. In this project, we examined ways to make this investigation easier and less invasive. Since collection of urine is easy and non-invasive, we focused on this medium. In this project we looked for biomarkers in urine both selective and sensitive enough to detect and/or exclude cervical cancer and its precursor lesions in urine. Parallel to this project, we collaborate with the TU Enschede to develop a lab-on-a-chip on which we intend to detect cervical cancer and its precursor lesions with our biomarkers and this technique.
In this project, we found:
Project 2. Developing screening test for ovarium carcinoma
In project 2, we showed that serum biomarker HE4, is useful in predicting whether an ovarian tumor is malignant or benign. About 50% of the referrals of women with an ovarian tumor turn out be incorrect after final pathology. This is a psychological burden for patients but also a financial burden for hospitals and society.
It is also a cost effective diagnostic tool. Circulating tumor DNA fragments can be useful to determine which tumors are ovarian cancer. Women with ovarian tumors are satisfied with their referral and treatment independent of the final diagnosis. Possible future developments include detection of hypermethylated DNA in urine or measurement of RNA in tumor educated platelets (TEPs). These different (molecular) biomarkers, can be added to ultrasound models and other patient variables to further optimize referral strategies and treatment.
Project 1. Developing a new screening test for cervical cancer
Cervical cancer is a rare disease of which precursor stages can be detected and treated. Women between the ages of thirty and sixty are invited to participate in the population screening. For this, the general practitioner will take a smear from the cervix. Unfortunately, four out of ten women do not respond to the call to participate in the population screening. Previous research has shown that most cases of cervical cancer occur in women who did not participate in the population screening. For this reason, this project is investigating whether cervical cancer and its precursor stages can be detected in urine by means of different disease markers (Human Papillomavirus, DNA methylation). In collaboration with the Technical University of Twente, we are working on the development of a urine chip "lab-on-a-chip". This could be a solution for women who would otherwise not participate in the population screening. In the future, this urine chip could also be used for population screening in developing countries where there is less good access to care.
In order to be able to research and develop this, urine, self-collected smear from the vagina and smear from the cervix are currently being collected from women with cervical cancer and precursor stages of cervical cancer. In addition, it is being investigated whether urine can also contribute to the detection of other gynecological cancers, such as endometrial cancer and ovarian cancer.
Project 2. Developing screening test for ovarium carcinoma
Ovarian cancer is a rare disease and in most cases it is detected at a late stage. In that case, the disease has a poor prognosis. Patients with early stage disease have a good prognosis. Patients with suspected ovarian cancer undergo staging surgery by a gynecologist-oncologist to determine the stage and thus the need for additional therapy. However, the current diagnostics consisting, which includes biomarkers, is not optimal, which means that it regularly occurs that patients with a benign ovarian tumor undergo surgery by a gynecologist-oncologist. This might lead to anxiety in the patients since they are referred because of an increased cancer risk and it also leads to increased health care costs as patients must again undergo several diagnostic tests. It also occurs that patients with ovarian cancer needs a second (staging) surgical procedure when they had their first surgical procedure in a peripheral center conducted by a general gynecologist. This is uncomfortable for the patients since they undergo two surgical procedures. Besides, it also leads to increased health care costs and it might lead to a delay in starting systemic therapy (such as chemotherapy) if indicated. Therefore, we are currently conducting a study in which we investigate the diagnostic value of other serum biomarkers in the differentiation between benign and malignant ovarian tumors. We look at, among other things, human epididymis protein 4 (HE4). The literature shows that HE4 is more specific than the most commonly used biomarker Cancer-Antigen 125 (CA125), which leads to fewer false-positive results. In addition, it has recently been shown that cancer can leave free DNA and RNA fragments in the blood. Various analyzes are used to determine whether these 'liquid biopsies' can be of value in the diagnosis of ovarian tumors. In addition to biomarkers in the blood, research is also being carried out into the value of structural change of DNA, so-called "DNA methylation", in urine and smears of patients with an ovarian tumor.